1999年，某个东西(📼)被(📒)卡(🏽)车运出了馆山(shān )市。几(jǐ )天(tiān )后，哥斯拉登陆了馆山，特(tè )生自卫队出动与(yǔ )之展开了苦战。在战斗中，自卫队员家城茜（釈(shì )由美子 饰(shì )）意(yì )外害死了战友叶山(🥄)二尉（森末(mò )慎二(🛺) 饰），自己却侥(✖)幸活了下来(🚑)，并被派(pài )(🤯)去(😱)了(🐖)资(zī )料(🔊)科。　　另(lìng )一方面，日本(🔢)政府(💱)在柘植(zhí )(🎛)真智(㊗)子首相（水野(📙)久美 饰）(🙌)的指挥下，召集了汤(tāng )(💪)原德光（(🈴)宅麻伸 饰）等(🔔)科学家开(kāi )始研究(jiū )(👺)对付(🏯)哥斯拉(lā )的(de )G兵器。他(🤖)们(men )以在馆山冲挖掘出来(💹)的初代哥斯拉(lā )骨骼为(wéi )基础，用了四年制(⛏)成了(le )机械(xiè )哥(🃏)斯拉——3式(shì )机(🐩)龙。柘植首相辞职，由科(📧)学技(😙)术厅(tīng )长官五十岚(lán )隼人（(👵)中尾(💸)彬 饰）就任新(🚲)首(shǒu )相。同时，茜被(🆙)派去了(💣)机(🔥)龙队(duì )(🌸)，担任机龙(lóng )的操作员。　　就(jiù )(🛃)在准备(bèi )机(jī )(💅)龙(lóng )测试机(✖)动时(💑)，哥斯拉又在东(dōng )京湾出现了。机龙赶赴现(xiàn )场与(🌲)哥(gē )(💕)斯拉(lā )对(🐌)战(zhàn )，却(què )因哥斯(sī )拉(lā )(⛅)的(de )吼声唤(huàn )醒了体内的野兽灵(líng )(📯)魂，突然暴走，在城(🐣)市(shì )中造(zào )(🎆)成了大破坏。　　为了改(😻)良(♈)机龙，汤原(🐑)改变了(le )机(jī )龙DNA计(jì )算(🖥)机的碱构造，使机龙(lóng )(🦄)不会再受哥(gē )斯拉叫声(🧔)的(de )干(gàn )扰。但由于对再次暴走(zǒu )(🛫)的担忧，五十(🦀)岚迟迟(🤙)不允许出动机龙(lóng )。　(🆕)　(😫)哥斯拉再度(dù )出现(xiàn )在(zài )(😇)东京(jīng )湾，一(yī )路(🙂)无视特(❣)生自(🥘)卫队的攻击来到了(le )品川，令(🖨)城市变(biàn )成了(le )一片(📻)火(huǒ )海。面对(🙋)如此(cǐ )(Ⓜ)情(qíng )景(jǐng )，五十岚(lán )终于同(🐎)意(yì )让机龙(lóng )出动。　　为(wéi )了打败哥(💻)斯拉，机龙被送到了品川。茜(qiàn )(🌔)也抱着必死(⚡)的觉悟。机龙和茜的战斗就这样(yàng )开始了。